深海水魚類最大的缺點是因為環境汙染，可能會造成海水魚類有重金屬汙染的疑慮，特別是汞汙染的問題。洄游性的大型魚類會經由食物鏈攝食，而累積汞在體內，尤其是食物鏈尾端的大型魚類，包括鮪魚和旗魚。自然界中的汞常以三種型式存在，包括金屬汞、無機汞、和有機汞等，其中以無機汞類的甲基汞為最常見的型態，毒性也最強，容易蓄積於體內。洄游性魚類因屬於大型魚類較多，且是食物鏈的最上層，最容易受環境污染所影響，這類型的大型魚容易含有較多的甲基汞。大量攝取甲基汞會損害神經系統，特別是發育中的嬰幼兒，腦組織發育易受汞的毒性影響。所以在製造過程均會針對魚肉的重金屬含量加以檢驗，以符合重金屬含量的國家標準。一般養殖的淡水魚在重金屬的汙染疑慮則較少。
|
類別項目 |
甲基汞 |
鎘 |
鉛 |
|
鯨、鯊、旗、鮪魚、油魚 |
2ppm以下 |
0.3 ppm以下 |
0.3ppm以下 |
|
鱈魚、鰹魚、鯛魚、鯰魚、鮟鱇魚、嘉鱲魚、比目魚、烏魚、魟魚、帶魚、鯮、魣、烏鯧、鰔、鱘魚、金錢魚、鰻魚、梭子魚 |
1ppm以下 |
0.3 ppm以下 |
0.3ppm以下 |
|
其他魚類 |
0.5 ppm以下 |
0.3 ppm以下 |
0.3ppm以下 |
|
貝類 |
0.5 ppm以下 |
2 ppm以下 |
2ppm以下 |
|
頭足類(去除內臟) |
0.5 ppm以下 |
2ppm以下 |
1ppm以下 |
|
甲殼類 |
0.5 ppm以下 |
0.5ppm以下 |
0.5ppm以下 |
資料來源：水產動物類衛生標準
